22 февраля (4 марта) 1681 года подписан указ Великим Государем Царем и Великим князем Феодором Алексеевичем, всей Великой и Малой и, Белой России Самодержцем и по благословению Великого господина всесвятейшего Иоакима (Савёлова), архиепископа Московского и России, и всех северных стран патриарха, отправлена за озеро Байкал духовная миссия, названная Даурской и ставшая первой православной миссией в Забайкалье.
Для строительства монастыря на берегу Селенги членов миссии 300 рублями и богатой церковной утварью, включая царские врата, "оправленные серебром".
В регион переселялись старообрядцы, и их возвращение в истинную православную веру было не меньшей задачей, чем обращение иноверцев.
Даурскую духовную миссию возглавил игумен Феодосий из Санаксарского темниковского мужского монастыря. С ним отправились 2 иеромонаха, один иеродьякон и девять монахов.
Создать кафедру "в Даурах" просили уже через год, но на Московском соборе посчитали достаточным направления священнослужителей из Енисейской губернии, "а епископам в тех дальних городах ныне быть не удобно малолюдства ради христианскаго народа".
Троицкий монастырь на Селенге миссионеры основали в 1683 году, собор воздвигли в 1684, а через год и храм Николая Чудотворца. Строили монастырь и его храмы выходцы из Нерчинского острога.
Ограда вокруг монастыря была устроена с бойницами и в самом монастыре имелись "военные снаряды" для защиты от китайцев и монголов. Жертвователем и охранителем монастыря был Сибирский наместник и воевода, стольник Федор Алексеевич Головин.
В 1727 году создана самостоятельная Иркутская и Нерчинская епархия.
Даурская духовная миссия действовала до начала 1730-х годов.